Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pmfbp1Q9WVQ0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms