Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Clcn5Q9WVD4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms