Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms