Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scnn1bQ9WU38 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms