Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms