Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax2Q9WTP9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax2Q9WTP9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms