Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms