Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NbnQ9R207 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NbnQ9R207 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NbnQ9R207 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms