Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms