Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsjQ9R014 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CtsjQ9R014 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsjQ9R014 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsjQ9R014 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsjQ9R014 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsjQ9R014 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsjQ9R014 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsjQ9R014 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsjQ9R014 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsjQ9R014 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsjQ9R014 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsjQ9R014 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsjQ9R014 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsjQ9R014 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsjQ9R014 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms