Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp21Q9QZL6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp21Q9QZL6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms