Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZK7

Dok3, Docking protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok3Q9QZK7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dok3Q9QZK7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dok3Q9QZK7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms