Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndrg3Q9QYF9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms