Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc5Q9QX29 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms