Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer2Q9QWW1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Homer2Q9QWW1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms