Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chaf1aQ9QWF0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chaf1aQ9QWF0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms