Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dkk3Q9QUN9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms