Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln8Q9QUK3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms