Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmub1Q9JMG3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms