Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt1Q9JMD1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sfmbt1Q9JMD1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms