Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prg4Q9JM99 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prg4Q9JM99 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms