Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg3Q9JL95 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms