Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp4Q9JKV5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms