Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms