Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms