Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uchl3Q9JKB1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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