Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msgn1Q9JK54 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msgn1Q9JK54 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms