Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga3Q9JJZ8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga3Q9JJZ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga3Q9JJZ8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga3Q9JJZ8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga3Q9JJZ8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cnga3Q9JJZ8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
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