Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tuba8Q9JJZ2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tuba8Q9JJZ2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tuba8Q9JJZ2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tuba8Q9JJZ2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tuba8Q9JJZ2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tuba8Q9JJZ2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms