Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfra4Q9JJT2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra4Q9JJT2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms