Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms