Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Efcc1Q9JJF6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Efcc1Q9JJF6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms