Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms