Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cxcl11Q9JHH5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl11Q9JHH5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms