Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn10Q9ESK3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn10Q9ESK3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn10Q9ESK3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms