Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ube3bQ9ES34 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3bQ9ES34 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3bQ9ES34 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3bQ9ES34 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3bQ9ES34 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3bQ9ES34 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3bQ9ES34 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3bQ9ES34 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube3bQ9ES34 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ube3bQ9ES34 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms