Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tfip11Q9ERA6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfip11Q9ERA6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms