Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms