Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spock2Q9ER58 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spock2Q9ER58 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spock2Q9ER58 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Spock2Q9ER58 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spock2Q9ER58 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Spock2Q9ER58 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Spock2Q9ER58 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spock2Q9ER58 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spock2Q9ER58 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Spock2Q9ER58 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spock2Q9ER58 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms