Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cpsf1Q9EPU4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cpsf1Q9EPU4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cpsf1Q9EPU4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms