Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r53Q9EP93 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r53Q9EP93 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms