Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pop7Q9DCH2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop7Q9DCH2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop7Q9DCH2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop7Q9DCH2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop7Q9DCH2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop7Q9DCH2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms