Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syde1Q9DBZ9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms