Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf6Q9DBU5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms