Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc97Q9DBT3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms