Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Med27Q9DB40 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med27Q9DB40 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms