Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop5Q9DB28 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Pop5Q9DB28 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Pop5Q9DB28 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Pop5Q9DB28 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop5Q9DB28 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms