Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smdt1Q9DB10 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 536 ms