Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9U9

Cfap45, Ccdc19 protein, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap45Q9D9U9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cfap45Q9D9U9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfap45Q9D9U9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap45Q9D9U9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap45Q9D9U9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap45Q9D9U9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap45Q9D9U9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap45Q9D9U9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap45Q9D9U9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap45Q9D9U9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap45Q9D9U9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap45Q9D9U9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap45Q9D9U9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms