Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnot8Q9D8X5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms